許多人以為，愈濃的咖啡咖啡因愈高，想當然爾醒腦效果愈好，事實上並非如此
濃淡和咖啡沖煮時加了多少水分有關，反而與當中的咖啡因含量沒有直接相關。
影響咖啡因萃取的原因很多，包括咖啡豆種類、研磨顆粒大小、沖煮方法、浸泡時間、溫度高低等因素，都讓一杯咖啡發揮不同的醒腦效果。
咖啡豆品種是影響咖啡因含量的重要因素，植物學分類上咖啡屬的茜草科（Rubiaceae）植物，其下有近百個物種，但真正具有商業價值並且適合大量栽種的是阿拉比卡（Arabica）和羅布斯塔（Robusta）兩種，其中阿拉比卡因味道柔和、香氣較濃而較受大眾歡迎，佔全球咖啡產量的六～七成；而羅布斯塔又稱粗壯豆，植株對病蟲害的抵抗力強，可生長在環境惡劣的地區，但所生產的咖啡豆味道苦、雜味重，通常用於廉價咖啡、三合一咖啡或調味原料。
兩個物種的咖啡因含量大不同，阿拉比卡豆的咖啡因平均占豆重的1.2％，但羅布斯塔豆則高達2.2％，因此，若喝到品質較差、混摻羅布斯塔豆的咖啡，不但味道較苦雜，攝取到的咖啡因也較多。
台灣市面上以阿拉比卡豆的流通為多數，在同樣品種的前提下，咖啡豆磨得愈細、泡得愈久，溶出的咖啡因也愈多，提神醒腦作用較好。
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