人體內的有益細菌或真菌主要是：酪酸梭菌，乳酸菌，雙歧桿菌，嗜酸乳桿菌，放線菌，酵母菌等。最常見的細菌是脆弱擬桿菌，它們可以幫助身體產生維生素K，並對抗致病菌以保護我們，乳桿菌有助於消化都會稱呼他們是消化菌。
益生菌不是一種細菌，它們都是對宿主有益的活性微生物，主要存在於人體腸道和生殖系統中，對維持宿主的微生態平衡起著至關重要的作用，對宿主有益的常見益生菌是乳酸菌，酵母菌，歧細菌，嗜酸乳桿菌等。
腸道菌群可以分解消化道中存在的食物中的含氮化合物，促進蛋白質的消化和吸收，雙歧桿菌、乳酸菌可以改善鐵的吸收。雙歧桿菌植酸酶可以促進礦物質，特別是鋅的滲透性，並幫助腸道從食物中攝取礦物質。
腸道環境的最佳狀態是有益細菌占主導地位，腸道環境是酸性的。有益細菌產生必需的維生素，並抑制導致食物中毒的病原體的生長和繁殖。此外，有益細菌產生身體所需的大部分酶，益生菌可以維持使用者的腸道健康，抑制有害細菌的繁殖，益生菌還可以產生多種參與食物消化過程的酶，有利於腸道消化系統健康，增強腸道免疫力，這些就是為大家所介紹的消化菌。
