益生菌廣泛的作用被越來越多廠商認可並應用在各種食品上，我們市面上所買到的益生菌都是屬於健康食品的一種，那益生菌要吃多久才會有效果，每種含益生菌的食品都是一樣的嗎？只要有添加益生菌舊型？那益生菌是否要長期吃呢？這裡帶來專業的分析，大家可以參考看看，希望看完就不再迷惑多花了冤枉錢。
當遇上了急性胃腸炎，一般所想到的就是止痛、止瀉、止吐之類的作法，而除了這些，近期的醫生開始會搭配益生菌讓幫我們的腸胃做輔助治療，大部分醫院所開的益生菌一般是有醫療效果的特定性，菌落的數量也可能比較大，針對性質較強，所以使用後效果感覺會比較快些。通常一星期到半個月可以感受到效果。但是若是自己在外面購買的益生菌，無論是針對胃腸疾病（如腹瀉、便秘、免疫力、調整體質、針對過敏等。），由於這些調理本身就需要一個完整的過程。譬如，調整體質的益生菌就需要在體內一段時間後經過一些歷程才能發揮該有的作用，用來維護人體健康體質。
但無論如何，首先要買對益生菌產品，我們知道細菌有很多種類，但不全然都是壞菌，也有對寄生於體內幫助維持健康並能供應養分對宿主有幫助的好菌，而益生菌顧名思義就是有益宿主的活菌的統稱，能幫助吃下肚的宿主維持健康，益生菌要有作用，最好就是維持活菌狀態，到人體內才能夠有作用，所以挑選的前提下，要了解產品是否有活菌，產品來說粉狀是最佳選擇，所以那些標榜糖果類的就當作點心吃吧。
我們說過服用市售的益生菌，需要在體內一段時間後經過一些歷程才能發揮該有的作用，才能用來維護人體健康體質。那麼大約要多久的時間呢？
剛開始的１～４週：體內菌種環境競爭期
在開始服用益生菌的１～４週左右，益生菌開始會和腸道內已經存在的有害菌與中性菌展開地盤競爭，就如同軍隊打仗一樣，競爭營養、生存環境、競爭附著在腸道壁上的位置來獲得地盤居留。（這也是剛開始我們說為什麼益生菌近期腸胃科醫生也都會開益生菌來搭配藥吃，目的就是為了要趕跑壞菌。）
這時候會出現細菌們在腸道裡戰爭最開始的階段。是最容易會造成人體不適的階段，這時期會嚇到很多人，以為吃了益生菌有了嚴重的副作用，但其實，這不算是副作用，不過這在醫學稱呼為「赫氏消亡反應」，也是俗稱「好轉反應」。在這一階段。由於益菌的入侵攻擊後，有害菌死亡時會釋放大量毒素和其它代謝不好的產物，益生菌也會釋放大量細菌素（bacteriocin）和各種有機酸來消滅有害菌。這場起始戰役雙方的死亡量都會很大。所以人體在此時有時會有腹痛腹瀉情況，大可放心的使用。若擔心的腹瀉太嚴重，可以減半使用的，讓身體習慣後再回到原本的量。
服用益生菌4～8週：益生菌優勢期
一般持續使用益生菌４～８週，持續的食用相當於在這場戰役中不斷補充益菌援軍，在４～８週這個階段，持續補充的益生菌會在這段戰役逐漸佔上風，由於這段時間持續補充益菌，腸道內的有害菌數量已經低於益生菌，這使得有害菌減少連帶釋放的毒素和其它有毒代謝產物的量大大減少，同時補充的益生菌也能幫助體內原有的有益菌生長並重新定殖在腸道內，並和體內原有的有益菌有互助合作用，維護腸道健康，並釋放人體所需礦物質。從這時間開始，人體才會開始感受到病症的改善。可惜的是，很多人到此階段就放棄了，認為有了改善就不吃，結果沒多久後身體又開始出現異常，浪費了
服用益生菌８～１２週：益生菌鞏固期
持續服用益生菌８～１２週後，益生菌已經慢慢定殖並且和體內原有益菌能夠一起作用互助，益菌在腸道內的比例越來越高，表示環境越不利於有害菌，因此有害菌的比例會越來越低。此時人體應該能明顯感受到身體改善。譬如不再常常腹瀉，腹脹，針對過敏的改善也可能發覺，流鼻涕、打噴嚏減少，鼻塞情況減低。但這時決不能掉以輕心，就停止不用了。
原因為有害菌的生存能力也是極為頑強的。研究顯示，大部分腸道有害菌都有較強的耐酸鹼性，耐膽汁和酶解的特性。
服用益生菌12週以上：穩定期
益生菌在體內佔有足夠優勢後，各種益生菌帶來的正面效果才會逐漸體現出來。為了鞏固地盤，防止體內的有害菌(有害菌很難被完全殺死，多數處於休眠狀態)，一旦腸道菌群失衡，就馬上會捲土重來，因此專家建議在服用過12週的益生菌之後，仍可以持續補充。
由於現在人的生活、飲食習慣等以及各種原因，壓力、飲食、睡眠等都很容易讓現代人的腸道菌群不能失衡，首先是飲食，壞菌跟人一樣喜歡火烤、油炸、甜點、含糖飲料等那些妳認為很美味的食物，所以除了要階段性的補充益生菌外，也要戒掉這些壞習慣平時要從飲食著手，不偏食除了肉類，蔬菜水果都要均衡，飲食不選高糖分飲料，喝白開水，作息要正常，睡眠要足夠等，這樣互相配合下，才能與益生菌相輔相成獲得好的體質。
